Si ya sabes como mirar en el Registry y diseñar tus genes usando ‘BioBricks', tienes que poner estas partes de ADN en lo que se llama un chasis biológico o una célula. Técnicamente, puedes modificar cualquier organismo conocido, como levaduras o E coli. Sin embargo, verás en el Registry que la mayoría de las secuencias están optimizadas para E coli. Es un organismo sencillo de usar como chasis biológico para tu recién construido BioBrick.
Antes de que introduzcas tu secuencia en E coli, debes crear células competentes. Las céulas competentes son aquellas que pueden incorporar ADN ajeno. Pueden hacerse artificialmente por inducción química o electroporación. Ambos procesos cream huecos en la pared celular que dejan pasar las moléculas de ADN a través.
Después de hacer células competentes, el ADN se introduce en la célula mediante un proceso llamado transformación. Típicamente, pones tu secuencia en un vector y después transformas el plásmido en E coli. El plásmido necesita un origen de replicación, que le permite ser replicado en la célula independientemente de los cromosomas celulares.
La transformación de plásmidos puede usarse para selección y screening. Esto se consigue añadiendo un marcador de antibióticos en el vector, y cultivando los E coli transformados en una placa de Petri con el antibiótico. Un marcador de antibióticos es una secuencia de ADN en tu plásmido que codifica para una proteína que hace a tus células resistentes a ese antibiótico. De esta forma, sólo los E coli que tengan tu plásmido van a sobrevivir, y las bacterias originales morirán por el antibiótico.
Puedes an*lizar tu recién clonado E coli extrayendo el plásmido, haciendo PCR o combinando PCR y electroforesis en gel. Puedes aprender más sobre estos protocolos en webs como addgene y otras que encontrarás en el material suplementario.