Dans cette vidéo, vous allez découvrir les composants biologiques standardisés connus sous le nom de Biobricks, apprendre comment utiliser la base de données des Biobricks et obtenir des conseils sur la conception de vos a**emblages d'ADN pour votre projet iGEM.
Juste pour rappel, les Biobricks sont des séquences d'ADN standardisées pouvant être utilisées pour concevoir des circuits synthétiques dans des organismes comme E. coli. Les Biobricks peuvent comprendre divers composants tels que des promoteurs, des séquences codantes, des sites de liaison aux ribosomes, des inverseurs, des squelettes d'ADN plasmidique et des séquences terminatrices.
Elles sont utilisées en biologie synthétique car elles sont standardisées et faciles à a**embler ou réa**embler en utilisant de simples techniques de biologie synthétique. Si vous voulez en apprendre plus sur ces composants, vous pouvez trouver plus d'information sur chacun de ces composants dans les ressources supplémentaires fournies ou dans des livres de biologie moléculaire.
Les Biobricks sont trouvées en libre accès sur le « Registry of Standard Biological Parts » développé par des chercheurs du MIT, Harvard et UCSF. Dans ce registre, on peut trouver des informations et des informations et des descriptions sur tous les différents composants, ainsi qu'un catalogue qui décrit les fonctions, rôles et a**emblages de chaque composant. Chaque Biobrick est décrite par un unique code d'identification pour simplifier les recherches. La plupart des composants du registre sont envoyés par des étudiants de premier cycle universitaire participant à iGEM. Il est important de garder à l'esprit que de nombreux composants manquent de données de caractérisation.
Il existe également des registres professionnels de composants ; l'un des plus importants est l'établissement BIOFAB (International Open Facility Advancing Biotechnology) au financement public, basé aux Etats-Unis et comportant plus de détails sur chaque composant.
Intéressons-nous maintenant à un exemple de l'équipe iGEM Paris-Bettencourt 2014. Un des sous-projets vise à créer une bibliothèque d'enzymes produisant des odeurs. Dans ce but, nous avons créé plusieurs a**emblages dans des plasmides en utilisant des composants du « Registry of Standard Biological Parts ». Une des odeurs que nous avons essayé de produire est celle de la banane ! Pour ce faire, nous avons trouvé une Biobrick contenant la séquence d'une enzyme qui produit l'odeur de la banane. Cependant, cette Biobrick ne présentait pas de promoteur pour permettre la transcription de l'enzyme. C'est pourquoi nous avons trouvé un promoteur dans le registre et nous l'avons cloné en amont de la séquence de l'enzyme. Ainsi, nous avons conçu un dispositif génétique qui présentait un promoteur et un gène d'intérêt et nous l'avons cloné dans E. coli afin de créer une culture d'E. coli qui sentait la banane.
En utilisant ces outils de libre accès, vous aussi pouvez commencer à concevoir vos Biobricks et a**embler des composants dans des dispositifs génétiques et des circuits.